Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DESP17661 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DESP17661 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DESP17661 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms