Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms