Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN2P0C2S0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN2P0C2S0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTXN2P0C2S0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms