Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1BGP04217 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1BGP04217 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A1BGP04217 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A1BGP04217 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms