Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP6O75581 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRP6O75581 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP6O75581 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP6O75581 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP6O75581 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP6O75581 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP6O75581 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms