Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5O75197 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5O75197 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP5O75197 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5O75197 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP5O75197 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms