Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF646O15015 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms