Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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