Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms