Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms