Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXQ1Q9C009 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXQ1Q9C009 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXQ1Q9C009 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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