Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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