Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms