Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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