Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms