Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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