Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHHQ15465 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHHQ15465 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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