Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EEA1Q15075 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
EEA1Q15075 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
EEA1Q15075 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
EEA1Q15075 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
EEA1Q15075 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
EEA1Q15075 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms