Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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GPNMBQ14956 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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