Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms