Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
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NEDD9Q14511 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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