Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms