Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CAMK2BQ13554 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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