Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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BPTFQ12830 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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