Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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