Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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RABGEF1Q9UJ41 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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