Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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