Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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