Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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