Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SIX1Q15475 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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