Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CHD4Q14839 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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