Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SQLEQ14534 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQLEQ14534 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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