Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms