Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CUL3Q13618 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CUL3Q13618 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CUL3Q13618 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CUL3Q13618 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CUL3Q13618 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL3Q13618 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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