Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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