Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms