Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms