Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms