Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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