Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXC1Q12948 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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