Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms