Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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