Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FAM53CQ9NYF3 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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