Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGPEP1Q9NXJ5 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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