Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TPRNQ4KMQ1 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TPRNQ4KMQ1 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms