Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms