Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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