Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms