Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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E2F4Q16254 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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