Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms